财政专项资金是指为实现某一事业发展和政策目标或者完成特定工作任务，由财政性资金安排的，在一定时期内具有专门用途、绩效目标和指定用途的资金。与其他资金相比较，财政专项资金具有如下特点：

第一，财政专项资金通常是全额或者部分由财政预算拨款的，所以它也属于财政资金的一个组成部分，对财政专项资金的安排也必须遵循公平和效率原则，使资金的使用效益最大化。

第二，根据各省财政专项资金的管理办法，在审批时通常要求财政专项资金有明确的绩效目标，它在设立时就设定了明确的效果目标。

第三，财政专项资金通常有明确的管理制度，资金的下达、拨付的时间和程序都有明确的规定，资金的使用范围和用途也有明确的规定，强调专款专用。

第四，财政专项资金具有很强的政策性，它的设立通常是为实现某一事业发展和政策目标或者完成特定工作任务，政策目标明确。

第五，为了实现各种各样的社会经济目标，财政专项资金种类众多。

财政专项资金的特点决定了对财政专项资金的绩效评价不同于对私有资金的绩效评价，也不同于对一般公共财政资金的绩效评价。财政专项资金的绩效评价有如下特点：(www.daowen.com)

第一，对财政专项资金的绩效评价首先应该评价其设立是否符合财政资金使用的公平和效率原则。

第二，在对财政专项资金的绩效评价过程中必须与专项资金设立时提出的项目可行性报告中的绩效目标进行比对。在对财政专项资金进行绩效评价时还必须考虑行业指标，以便为提出更好的建议提供对比分析依据。

第三，按照管理制度的规定，应在规定的使用范围内使用专项资金，按照规定的程序进行财政专项资金的变更，按照年度预算和实施计划来安排资金进度是对财政专项资金使用的基本要求，对财政专项资金进行绩效审计时一定要包含资金管理方面的评价内容。

第四，对财政专项资金的使用绩效进行评价时应保持动态性，因为财政专项资金设立的目的就是实现某一事业发展和政策目标或者完成特定工作任务，随着经济社会的发展和政府工作重点的变化，财政专项资金的目的也会改变，所以对财政专项资金绩效的评价不可能是一成不变的，在评价过程中也要特别注重其对政策的执行程度和效果。

第五，由于财政专项资金包含的种类众多，所以对财政专项资金绩效的评价是一项系统工程，涉及多方面的综合知识。而且对不同种类的专项资金的评价可能要采用不同的评价指标，不可能有一个统一的评价指标体系，这就决定了专项资金绩效的评价指标体系是分类别的，不同类别的专项资金绩效评价过程需要不同的指标。