目前，中国农业面源污染问题较为严重，主要原因是化肥、农药的大量投入以及畜禽养殖粪便排放。具体来说，当前化肥使用现状不合理，主要包括以下四个方面：一是化肥亩均施用量偏高。2015年，中国农作物每公顷化肥折纯量为361.99公斤，远高于每公顷120公斤的世界平均水平。二是施肥不均衡现象突出。东部经济发达地区、长江下游地区和城市郊区施肥量偏高，蔬菜、果树等附加值较高的经济园艺作物过量施肥比较普遍。三是有机肥资源利用率低。目前，中国有机肥资源总养分约7000万吨，但并没有得到充分利用。农业部的统计数据显示，当前中国畜禽粪便养分还田率为50%左右，农作物秸秆养分还田率为35%左右。四是施肥结构不平衡。化肥与有机肥的施用比例仍存在着较大差异，农业生产中普遍存在着重化肥、轻有机肥，重大量元素肥料、轻中微量元素肥料，重氮肥、轻磷钾肥的问题。此外，农药的过量使用不仅造成生产成本增加，影响农产品质量安全和生态环境安全，也是造成农业面源污染的重要原因。这一方面表现在农药使用强度大幅上升，由1991年的每公顷农药使用量5.12千克，上升到2015年的每公顷农药使用量10.72千克；另一方面表现在农药使用结构不合理，杀虫剂、杀菌剂、除草剂三大农药使用结构比例与国际平均水平相比，中国杀虫剂的使用量偏高，除草剂仍有较大潜力，农药使用结构比例亟待改进。2010年《第一次全国污染源普查公报》数据显示，畜禽养殖业粪便产生量2.43亿吨，畜禽养殖业主要水污染物排放量中化学需氧量1268.26万吨、总氮102.48万吨、总磷16.04万吨、铜2397.23吨、锌4756.94吨，分别占农业源主要水污染物排放的95.78%、37.89%、56.34%、97.76%、97.82%，畜禽养殖污染已经成为农业面源污染的主要来源。(www.daowen.com)