复杂系统建模按照构建模型的系统属性、构成特性等的不同可以应用不同的建模方法。以下是8种最为常见的复杂系统建模方法：

（1）推理法。主要适用于“白箱”系统，即系统内部结构以及基本特征均已比较明确，通常利用已知理论或定律，对系统加以分析并推理，从而得到相应的系统模型。

（2）模拟法。主要适用于“灰箱”系统，即系统内部构以及基本特征不完全清楚，通常通过建立相应的计算机仿真模型来模拟系统相关行为，并通过参数的输入和仿真结果的评价确认系统模型。

（3）辨识法。主要适用对于“黑箱”系统，即系统内部结构以及基本特征均不清楚，一般通过对系统输入输出参数的测量，根据一定的标准辨识系统特性并建立系统模型。

（4）统计分析法。如果对内部结构以及基本特征均不清楚，且系统不方便测量，一般通过对系统历史数据的统计分析构建系统模型。(www.daowen.com)

（5）情景分析法。对于一般概念模型，根据丰富的实践经验和严密的逻辑推理，设想系统所处的环境和状态，预测未来相关技术、经济及社会后果，以此来构建系统模型。

（6）德尔菲法（Delphi Method），又称为专家调查法。征求相关领域专家意见并对其统计分析并反馈，使专家意见不断提升，以此建立相关系统模型。

（7）复杂网络建模技术。对于复杂且带有随机性的网络系统，通常采用复杂网络建模方法。复杂网络建模方法对于揭示复杂系统的小世界效应、无标度特性和高聚集性等特征具有明显优势。

（8）混合法。一般的系统往往复杂多变，采用单一方法难以准确描述系统结构及基本特征，此时常常采用多种方法混合使用来构建系统模型。