配送商品单一，配送车辆装载率难以保证。卷烟配送采用自营物流配送模式，配送车辆只装载配送区域内的卷烟，配送商品单一，受到配送车辆行驶距离的限制，部分送货量小且零售客户分散的区域，配送车装率较低，是对物流资源的浪费。

卷烟配送受行政区划限制。我国烟草行业实行垂直管理体制，省级烟草商业企业下设多个地市级烟草公司，省级烟草商业企业按照区域内卷烟配送需要建设若干个卷烟配送中心，而卷烟配送中心归属与配送中心所在地的地市级烟草公司管辖，并完成所辖片域的卷烟配送业务。严格的区域划分限制了配送线路更大范围的优化，最极端的现象便是处于相邻两个片域边界附近的配送点无法接受跨区域的卷烟配送服务，致使两个片区的配送车辆在行驶较远距离后分别完成配送活动。(www.daowen.com)

卷烟配送业务涉及多个职能部门，权责划分不清晰。卷烟配送中心是由配送中心所在地的地市级烟草公司管辖，与此同时，省级烟草商业企业也设有与地市级烟草公司同等级的物流分公司，物流分公司不对地市级烟草公司负责的卷烟配送中心的配送业务进行直接管理，无法掌控具体的卷烟配送费用，但在成本核算时却要承担所有因配送卷烟而产生的费用，权责划分不清晰，不利于省级烟草商业企业的对标管理。