在传统发展观指导下的农业活动，往往造成大量的化肥、农药及其他有毒有害的农业废弃物在其生产过程中进入大气、土壤和水体中，不可避免地污染生态环境、破坏生态资源。正是这种长期对生态环境与资源破坏式的开发利用，导致当今世界农业发展不仅面临人口增长对农产品需求不断加大的问题，还面临资源与环境的双重约束，制约了现代农业的可持续发展。农业生态资本投资遵循循环经济的“再循环、减量化、再利用”原理，建立和发展一种多层次、多结构、多功能的集约经营方式，以期获得较高的经济效益、生态效益和社会效益。其本质是把市场、资源、生态、技术等约束变量内生化到农业体系内，使事后监督转为过程控制。显然，这种新型农业发展模式可以有效解决资源与环境对农业发展的双重约束。因此，绿色农业生态补偿使人们把生态资源看作具有经济价值的物品来进行管理，有利于“高污染、高消耗”的传统农业生产方式向绿色农业生产方式转变，进而促进生态环境与资源的恢复与保护，有效遏制生态环境的污染和生态资源的破坏，并确保自然资源的开发利用建立在生态系统自我恢复能力可承受的范围之内，以实现农业可持续发展。

同时，农业生态补偿能够保护农民从事农业生态资本投资活动的积极性。农民如果采取像农业生态资本投资这样可持续的生产方式往往容易增加成本，再加上生态外溢性特征，利润非常薄弱，甚至亏损。如果农民得不到一定补偿，他们更容易倾向于采取虽然可能破坏生态环境但成本却低得多的生产方式，从而导致生态环境恶化。与此同时，如果农民采取的是生态系统服务功能保护型的可持续性农业生态资本投资方式，必然能够为外部提供生态服务效用和价值，这是一种正外部性贡献，外部应该“感激”并为农民的这种“付出”买单，以促使农民的这种外部性内部化。因此农业生态补偿是确保农民经济利益平衡的关键，有利于实现社会公平，保障农业生态资本投资的可持续发展。(www.daowen.com)