EDI以电子文件替代了纸面文件，但电子文件的内容，只有在与数据处理系统的硬件软件结合时，才能显示出来。网络与数据处理系统的不稳定性、电子文件的可修改性与易复制性，会产生一些“失真”现象。这就使得EDI技术对建立在纸面文件上的传统国际贸易法律制度产生了极大冲击，并产生许多新问题。

电子商务在发展的同时，所引发的许多法律问题也正在逐渐显现，比如电子合同的法律效力、网上支付各当事人之间的法律关系、电子身份认证的法律地位、物流配送的物权归属、网上消费者权益保护、税收征管、知识产权保护、电子商店的法律责任等等，EDI所引发的法律问题主要包括：

1．单证形式

许多国家都要求以书面单证作为证明交易有效的依据，EDI下买卖双方采用电子文件方式，内容通过计算机屏幕显示，尽管屏幕内容可以打印，但与传统上的书面形式却是大相径庭。

2．签字和认证

许多国家法律要求某些合同、文件或单据必须经当事人签名或书面认证。EDI交易虽有电子签字技术，但对签字的认证也是一个重要的法律问题。(www.daowen.com)

3．电子合同

电子合同涉及要约、承诺、合同成立时间和地点等问题。EDI合同订立是一种自动化操作，要约和承诺因传送、操作失误等原因常常不是当事人的真实意思，而这种错误往往在合同被执行后才能发觉。这就涉及该合同能否依传统法律原则被认定为无效或撤消等问题。EDI合同下表示承诺的文件可以在任意时刻、任意地方发出，涉及合同成立时间与地点问题。

4．电文传递中还涉及安全和证据问题，如，如何防止出错、篡改、欺诈和将电子数据内容泄露给未经授权的人；未发通知或通知错误的责任问题；存储在计算机内的电子文件能否在诉讼中被法院采纳为证据及其价值、如何界定EDI贸易中的原件问题等。

5．管辖权与法律适用问题。传统法律的管辖权确定和准据法选择都是以连接点为依据或纽带的，如“缔约地”、“履行地”、“侵权行为地”等，电子合同下需要确认网络环境中的连接点及如何确定新的连接点问题。

这些法律问题用传统商务法律规范很难解决，但如不能及时有效地予以解决，这些法律问题的出现必将成为制约电子商务进一步发展的瓶颈。这些问题说明，电子商务要进一步发展尚未完善的法律支撑环境。