经济功能区虽然设立的时期不同、定位不同，改革创新的侧重点也有所区别，但他们均为国家战略，使命相通、优势互补则为它们实现联动发展提供了基础条件。

（一）任务相合是联动的保障

探索创新、先行先试，发挥示范引领作用，是经济功能区使命的相通点。如自创区和新区都在推进股权激励、科技金融、人才试验区、财税政策和管理体制机制改革，这与自贸区的金融领域开放、负面清单管理，以及从审批制到备案制等一系列政策创新相结合，促进自贸区制度创新、开放创新、金融创新与自创区、新区科技创新的多维度融合，可打通创投资本的“进退通道”，通过建设科技金融、创新成果转化等平台，实现区域空间载体升级、企业集聚和功能拓展。从而实现制度创新与政策试点的相得益彰，有利于放大改革红利、提升开放水准、激发创新潜能，形成“1+1＞2”的累积叠加效应。(www.daowen.com)

（二）优势互补是联动的基础

在发展资源禀赋方面有互补点，这是联动发展基础所在。从产业要素看，自贸区以探索高质量新模式为目标，通过制度创新发展高端服务业和高端制造业等产业。自贸区产业主要集中在金融服务、高新技术、现代物流等，更强调高质量第三产业的集聚，设立之初就对入驻企业设有筛选标准。从开放创新模式看，自贸区的国际贸易窗口，可为其他经济功能区深入实施国际化发展战略提供便捷通道；经济功能区所拥有的创新体系、新兴产业和科技成果优势，也可成为自贸区拓展对外贸易的“后台”资源。很多企业在科技研发过程中需要进口国外高端设备和各类实验制剂，而自贸区对企业自用研发设备和进口研发耗材在进口税收方面的优惠政策一旦复制推广到自创区，能为高科技企业的研发试验提供极大便利。