企业的创新运行机制包括企业的组织状态、运行效率和管理体系。企业的创新是多部门效率运行的结果，是企业管理制度环境的体现。产品或服务创新的出现首先来自创意的产生，这是创新活动的第一个阶段。创意的产生需要自由开放的工作环境。研发人员在构思创意的阶段需要大量的时间去获得相应的信息。同时，还需要为研发人员提供相应的报酬体系。创新活动具有长期化和需持续投入的特点，创新产出之前企业需要为研发人员提供合理的报酬体系，使其能专心地投入研发活动。

创新活动的第二个阶段就是创意的报告阶段。研发人员会将创意的形成和论证形成报告。报告的实现和执行依赖于管理人员的创新意识和企业家的抱负。同时，需要整合企业内各部分资源。一旦进入开发阶段，企业势必要进行大规模的实验和投资。在开发阶段，各部门需要统一思想、统一目标、分工明确，还需要具有相应的自主性，对实验阶段的产品或者服务进行微调，不断改进项目实施和运行，达到契合市场需求的目标。

企业创新运行机制的最后一个阶段是创新产品或者服务的应用阶段。企业需要从技术、设备和市场三个方面发力：通过设备的生产获得技术实现的基础，通过市场销售实现产品或者服务的利润，通过企业内部的薪酬体系实现利润收益的内部化，进一步增强员工的创造性。(www.daowen.com)

不同创业企业的创新机制运行过程具有以上相同的特征。不同的是，创业企业在对不同项目进行同时研发时，需要大量持续的资金投入。创业企业初立于市场，其在外部关系的构建和社会网络的参与上都处于弱势地位，只有通过创新，才能克服外部不确定性问题^[3]。同时，创新产品或服务的应用阶段需要采购或者生产一定规模的设备，用来实现技术的市场化，市场的销售阶段需要大量的资金用来拓展市场和投放广告，这些无不需要大额资金的投入。因此，创业企业迫切需要外部资金的扶持来实现创新运行机制。