远航筹备并不像阿尔瓦列什旁观的那样顺利，麦哲伦经常要为许多事情没完没了地与国王和相关部门通信。曾经几度，麦哲伦甚至觉得，船队未及起航，已经快前功尽弃了。

完整装备大船队，总共需要 800 万马拉维迪，可司库突然宣布，东印度公司钱库空了。似乎因为缺钱，远航要无限期拖下去。麦哲伦说服宫廷，转而接纳一批富商参与他的事业，于是亚罗匆忙组织财团，送来了200万。作为回报，这些财团得到了以同等条件参加探险活动的权利。

资金问题解决了，接着又出现了其他状况。一会儿是在其他省份甚至远在德国采购的货物没能按期送到，一会儿是缅多萨船长粗鲁无礼地拒绝服从命令，当着船员的面羞辱海军上将，但麦哲伦却不能开除他，因为他是国王强加给船队的司库。

不过，没有任何事可以阻挡麦哲伦，他的决心已定。

破旧的帆船全部修理完毕。甲板洗得焕然一新。从桅杆梢头到船舱龙骨，全部涂好焦油，打了蜡。腐烂的长木方梁全都换上了新木。风帆用新染的粗麻布做好，很结实，上面印着圣地亚哥的十字架。锚链和缆绳全部更新，锚擦得闪闪发光。船上每一个小部件都配制得一丝不苟。

五艘船满载货物，只待出海命令。(www.daowen.com)

此时，阿尔瓦列什来到麦哲伦家，做最后的挑拨离间。

他劝麦哲伦不要相信西班牙国王的承诺，不要相信红衣主教的甜言蜜语，国王的确是任命他和法利罗为海军上将，似乎授予他俩指挥船队的全权，但他是否能肯定，国王没有向其他人下达暗中限制他们权力的密令。西班牙国王的担忧不无道理，谁背弃了一面旗帜谁就可能背叛另一面旗帜，谁背叛了一位国王谁就可能背离另一位国王。阿尔瓦列什明确告诉麦哲伦，国王安插在船队的那些官员，都接受了国王的各种秘密指示。

麦哲伦不由自主地打了一个寒战，他不禁自问，国王违背合约，禁止他招募五名以上的葡萄牙人，难道不是怀疑他的忠诚吗？他强塞进来的这些人——监察员、司库、会计——真的只是统计局的官吏？他们是否肩负着秘密监视他的特殊使命，随时可能剥夺他的指挥权？麦哲伦知道，面前这个消息灵通的特务居心险恶，但他的话无疑是真的。

他细细算了算，在他的265名属下当中，他能完全相信的仅有十人。片刻间，麦哲伦忽然有了不祥的预感，但他很快恢复了镇定。他断然回答阿尔瓦列什，即使西班牙国王不信任他，甚至最后不犒赏他的功绩，他都坚决不会和葡王签约。做人要厚道，他必须忠于自己做出的承诺，为西班牙国王效力。