帕卢德汗听到阿尔布开克的答复，命令部下建造大型木筏，准备运兵过河。5月10日夜里退潮时分，狂风大作，大雨倾盆，成群的木筏被推过河流的浅滩，坐上士兵后，漂到果阿海岸。混战中，葡萄牙人及其印度附庸被打得措手不及，他们溃败后丢弃了大炮，张皇失措地四处逃窜，一些土著部队叛变了。

最后，阿尔布开克和狄摩吉撤入城中，被四下围困，城里的穆斯林奋起反击，与葡萄牙人展开激烈巷战。不久，阿迪尔驾临前线，葡萄牙人在城墙上看见红蓝两色的旗帜和海洋一般的帐篷，顿感大难临头。

5月31日夜里，阿尔布开克准备突围，有人建议他放火烧毁全城，被他否决。他发誓，一定要重返果阿，把它变成上帝和葡王的土地。他命令狄摩吉，处死他们扣押的所有穆斯林，不分男女老少，再把马杀掉，把大炮火门钉死，烧毁兵工厂和所有军用物资。

狄摩吉并没有把所有在押穆斯林杀掉。他留下很多美女，让她们交出身上的珠宝首饰，然后女扮男装，藏匿在自己的船上。

突围过程中，葡萄牙后卫部队疯狂拼杀，抵挡追兵。阿尔布开克让人把胡椒和铜条撒在地上，追兵纷纷停下来捡拾，放慢了追击速度。最后，他们返回船队，在敌人的箭雨中顺流而下。在他们背后，传来阿迪尔的军号声，果阿人在庆祝收复城市。

雨季真的来了，劲风吹弯了棕榈树，暴雨抽打着船队和河面，曼多维河水量猛涨。阿尔布开克已无法出海，只得在河道中间下锚，被困在了这里。

船长们怨声载道，责备阿尔布开克固执，没能早些突围撤退。

阿尔布开克抛锚处的一侧岸边是帕纳吉（Panaji）要塞，当他拒绝了阿迪尔提出的所有让步条件之后，阿迪尔向要塞派驻了强大的部队，并在它的木制堡垒周边部署了火炮，同时他在另一侧河岸也部署了一个炮兵阵地。于是，阿尔布开克被两个炮兵阵地夹在中间，两岸同时向他张开血盆大口。他的海洋花旗舰，因为悬挂着司令旗帜，是最显眼的目标，有时它一天能中弹十发。每天醒来，葡萄牙人都能看见两个敌人阵地上旌旗招展，清楚地听到他们的军号、战鼓和呼喊声。(www.daowen.com)

6月，大雨停了，天一连放晴15天，没有雨水可供收集，饮用水没了。曼多维河因为海水倒灌，水太咸，无法入口。葡萄牙人不得不发动一次突袭，上岸去丛林中取泉水。但一滴水要用三滴血换来，他们死了一些人，给65个木桶装满了水。

大雨再次降临后，干渴消失，但饥饿又来了。船上给养所剩无几，阿尔布开克开始严格实施口粮配给制度，每人每天只能吃到二两半干粮，从河里抓到鱼，只能给病人食用。狄摩吉经常派人偷偷上岸，尽其所能，搜寻食物。但口粮依然严重匮乏，水手们开始猎杀船上的老鼠，那些拥有储物箱的船员揭下箱子的外皮，煮熟吃掉。

为了鼓舞士气，阿尔布开克提议再发动一次突袭，摧毁敌人的岸炮。

黎明前，葡萄牙人出其不意出现在河流两岸，击溃果阿的炮兵阵地，抢走大炮和食物。直到夜里，阿迪尔才派来援兵，可葡萄牙人早已回到船上。

阿迪尔下密令，在上游造一大批木筏，准备进攻葡萄牙船队。狄摩吉派间谍得到情报，阿尔布开克便先发制人，派带有轻型火炮的小船前去，把阿迪尔的木筏炸得粉碎。诺罗尼亚杀得兴起，看到一艘桨帆船停在岸边，想过去把它俘获拖走。他膝盖中箭，不得不撤退。

医治腿伤是远征作战中的大难题，因为感染和缺乏医药，腿伤死亡率很高。诺罗尼亚卧床不起，三天后死亡。阿尔布开克的这位外甥，是他和那些心有怨气的船长们的调解人，他曾安排过，如果他死了，就由诺罗尼亚接替他。外甥的死对他影响至深。

有一天，果阿新摄政王上船，提议把果阿城外一个良港给葡萄牙，那儿很适合建造要塞，此外还送给葡萄牙人五万克鲁扎多金币。而条件只有一个，就是把狄摩吉交出来。阿尔布开克简洁严厉地说，阿迪尔必须交出果阿，否则免谈。摄政王目瞪口呆，阿尔布开克粗暴无礼地赶他下船，临别告诉他，除非送来果阿的城门钥匙，否则不要再派使者。