回程的路上，船队开展了一些探险活动，获取了许多新的知识。

卡布拉尔派一艘船去探索红海入口，发现那里极端干旱，熔炉般酷热，不适合人类居住。船员除了雨天收集雨水，未找到其他淡水资源。那艘船归队时，只剩下六人，并且多数患病，其他人全部惨死。

经过马林迪时，因为操作不当，一艘满载香料的船触礁，好在水手们全保住了性命。为了防止货物被穆斯林抢走，他们放火烧了船，但莫桑比克的潜水员还是捞走一些火炮，这些火炮后来被用来对付葡萄牙人。

此时，葡王相信，他这次送给海王的贵重礼物肯定能确保友谊，让卡布拉尔友好解决问题，于是他开始准备下一批远航船队。3月，当卡布拉尔艰难驶向好望角的时候，在诺瓦（Joo Nova）的率领下，一支只有四艘船的商船队离开了塔霍河。

诺瓦抵达圣布莱斯湾时，看见一棵树上挂着一只鞋，里面有卡布拉尔留下的一封信，告诉葡萄牙同胞关于卡利卡特的局势。所以诺瓦绕过卡利卡特，在坎努尔和科钦装载香料，凭借船炮优势，在海王船队的追击下全身而退。

1501年夏季，卡布拉尔的远航船队分批返回里斯本，其中两艘船是空驶，其他船满载香料。教堂钟声响起，朝廷下令，全国举行宗教游行，庆祝胜利。(www.daowen.com)

这次远征，标志着葡萄牙人已经从探险侦察，转化为商贸和征战。

那时候，威尼斯垄断着欧洲的香料贸易。他们想方设法，维护与埃及奴隶王朝的关系，确保他们的船队每年能从亚历山大港买进大批香料，香料贸易一直是它的生命线。葡萄牙人成功绕过这个垄断中间商，令威尼斯人瞠目结舌。卡布拉尔带回五船香料，价格低得令人无法相信。曼努埃尔一世志得意满地向地中海北岸宣布：“从此刻起，你们应当派遣船只，从葡萄牙购买香料。”

如果葡萄牙继续这样的远航运货，所有欧洲人都会跑到葡萄牙去买香料，威尼斯的繁荣就完蛋了。

不过，葡萄牙人并不能高枕无忧，卡利卡特的永久贸易站被摧毁，印度沿岸的统治者和绝大多数居民并非基督徒，这让他们倍感忧虑。