哥伦布死后第13天，斐迪南二世给奥万多签发了一封信，让他把哥伦布的黄金和其他财产交给海军上将头衔的继承人迪亚哥。这说明，国王并没有减少哥伦布的特权，而是限制那些被他认为是有害于国家的特权。而事实证明，迪亚哥的儿子——路易斯·哥伦布（Louise Columbus）——非但不能胜任世袭统治中美洲群岛的重任，他甚至连自己都管理不好。

入秋后，腓力一世在布尔戈斯死于斑疹伤寒，内战危险消弭无形。

此后，胡安娜彻底疯了，没人能把她从丈夫的尸体旁拖走。她整日整晚睡在尸体旁边，不让任何女性靠近灵柩，连修女也不行。她时常命人打开棺材，拥抱丈夫逐渐腐烂的尸身。

斐迪南二世设法使胡安娜承认他俩的父女共治权。之后，他把女儿囚禁在托尔德西里亚斯城堡中。

1508年，哥伦布的大儿子迪亚哥被任命为中美洲群岛的海军上将和海地岛总督，1509年赴任。1512年2月23日，斐迪南二世给迪亚哥写了一封严肃的信，说中美洲群岛上的居民应当成为臣民，而不是像过去那样被视为奴隶。(www.daowen.com)

1516年，斐迪南二世去世，留下一个堪称欧洲第一强国的西班牙。他被安葬在格拉纳达的皇家礼拜堂，和伊莎贝拉一世在一起。

从此，胡安娜的儿子卡洛斯一世获得母子共治权，他把母亲继续囚禁在托尔德西里亚斯城堡。1519年，西班牙爆发反对卡洛斯一世的城市公社暴动，起义者推举胡安娜为唯一女王。1522年，城市公社暴动被镇压，卡洛斯一世仍是共治国王。

胡安娜成为西班牙女王之后，她最亲近的三个人——丈夫、父亲、儿子——都是利用她才获得了合法共治权。然后又以她有精神病为名，无情地拘押她。

卡洛斯一世把妈妈关押在没有窗户的房间度过余生。1555年复活节前夕，胡安娜过世，也被安葬在格拉纳达的皇家礼拜堂，和父母、丈夫、外甥在一起。