郑和回到南京白下区马府街，仅住了11天，便率27000人再次远赴印度洋。与此同时，越南占城进贡的使者回国，船漂到了马来西亚的彭亨（Pahang ），被泰国抓住，泰国人向他索要财宝，将其羁押不还。另外，泰国恃强发兵，从苏门答腊和马六甲两个附属国抢走了永乐皇帝赏赐的印诰。

郑和由占城顺风十昼夜，来到泰国，向国王宣读永乐皇帝敕令。郑和说，占城、苏门答腊、马六甲，与你一同接受明朝恩惠，你怎能逞威扣押占城贡使，夺走苏门答腊和马六甲的诰印；天有显道，善福祸淫，越南黎贼被我除掉，请你引以为戒。泰国国王自感理亏，开始痛改前非，释放占城使者，把印诰还给苏门答腊和马六甲，并且派遣使臣去南京进贡，以谢前罪。

设想一下，如果不是郑和重兵压境，泰国国王是否会乖乖听话。可如果泰国国王不听话，郑和是否会发威弹压，情况犹未可知。

1408年夏季，郑和再过爪哇岛，西爪哇国王赔偿黄金一万两。消息传回朝廷，礼官以数额不足六万两，请求把西王抓进大牢。但永乐皇帝说，对于那么遥远的一个人，我只是想让他为自己的罪过感到害怕，哪里是真想要他的黄金，把这一万两黄金也退给他。西王感恩戴德，此后，隔三岔五向明朝进贡。

秋天，郑和自苏门答腊顺风十二昼夜，抵达斯里兰卡。

这一次，他想看看能否感动国王。斯里兰卡长期信奉佛教，郑和自己恰是虔诚的佛教徒，于是他布施斯里兰卡佛寺，立碑勒文，不过还是没能奏效。

郑和觉得阿烈苦奈儿的归顺问题不解决，仍是地区隐患。(www.daowen.com)

郑和回国后，住了三个月，于1409年10月从太仓刘家港起航，再度奔赴印度洋。第一站照例是占城，当地首领从大象背上下地，跪行匍匐，听郑和宣读皇帝诏书，获得赏赐。这时，越南已被明朝吞并，成为一个省，周边各国更加臣服，来中国朝拜的各国使臣日渐增多。

郑和特地在马六甲建立官仓，以利日后远赴印度洋购买进口商品的官方贸易。

从印度回程时，郑和三访斯里兰卡，他带着2000人下船，三劝阿烈苦奈儿国王改邪归正。阿烈苦奈儿轻慢不恭，不仅不去听永乐皇帝的诏谕，而且派儿子去索要金银宝物，被郑和拒绝。于是，阿烈苦奈儿集结50000兵马，分兵去劫郑和船队的钱粮。郑和正与国王属下谈话，得到对方暗示，紧急赶回船队，但归路被阻绝。郑和不愧是身经百战的职业军人，他对部下说，斯里兰卡这等小国，集结50000贼众去了海岸，国中必定空虚，我们只要出其不意地攻陷都城和王宫，一切便会妥妥的。于是他攻破都城，直接杀进王宫，生擒了阿烈苦奈儿全家。劫船敌寇听到消息，急忙回援，郑和舰队20000人上岸，与岸上的2000名官军前后夹击，大败敌军。

对此事的记述，斯里兰卡史书说，郑和是想抢走佛牙，斯里兰卡才发动的战争，此说不足信。观郑和七度往返印度洋，均秋毫无犯，不可能像欧洲航海军队那样进行抢劫。总之，这次军事自卫，对南亚国家起到了极大的震慑作用。

1411年7月6日，郑和回国，把斯里兰卡俘虏献给永乐皇帝，朝臣齐奏诛杀。但永乐皇帝怜悯阿烈苦奈儿无知，赦免了他们，还赐予衣食，让他们暂住中国。同时永乐皇帝命礼部商议，选中斯里兰卡贤者波罗伽罗摩巴忽六世。次年，永乐皇帝派使臣持诏书和诰印前往斯里兰卡，遣送阿烈苦奈儿回国，并封波罗伽罗摩巴忽六世为国王。

后来，波罗伽罗摩巴忽六世曾经亲自来明朝朝贡，他又派王子朝贡，王子留居泉州，娶妻生子，成了中国人。