瓜达尔港口建设最大的安全隐患来自当地的恐怖袭击。俾路支省内俾路支民族主义和哈扎拉民族主义矛盾丛生,民族分裂主义异常严重,此外,什叶派与逊尼派之间的教派冲突凸显。因此,当地成为巴基斯坦境内恐怖主义势力的重要构成部分。这为中国企业在当地的建设和自贸区的进驻埋下了重大隐患。全球恐怖主义数据库(Global Terrorism Data)数据表明,企业已经成为继当地政府军队、个人之后恐怖分子进行袭击的第三大风险目标。^[49]

在过去数年间,中巴在俾路支省合作建设的油气、港口、交通运输设施,甚至中方工程人员都成为俾路支省分离主义武装团体的攻击对象。2004年5月3日,中国交通部第一航务规划工程勘察设计院的12名监理工程师在瓜达尔港建设工地遭遇汽车炸弹袭击,3人遇难,9人受伤。2005年11月15日,数枚火箭弹袭击了中国新疆北新路桥公司在瓜达尔附近的筑路工地。2006年2月15日,对俾路支省胡布镇进行技术援建的中国工程师遭遇恐怖袭击,3人死亡。2007年7月10日,巴基斯坦再次发生由宗教极端组织造成的3名中国公民袭击致死事件。^[50](www.daowen.com)

这些恐怖袭击在造成人员伤亡的同时也不可避免地造成财产损失。在恐怖主义尤为严重的2009年,中巴双边贸易受到巨大影响,仅为67.8亿美元,同比下降2.9%。^[51]