系统科学方法论的五个基本要素是相互联系的，其中心是有机整体这一观念。具体而言，就是用联系的、动态的、反馈的观点看待一切经济监督现象。所谓联系的观点，就是认为现实中一切经济监督存在着普遍的联系，经济监督内部各要素也是按照一定方式组织起来的，它们自成系统，又互成体系。因此，认识经济监督的本质就不能把经济监督从复杂的联系中切割出来，孤立地加以考察，而必须把它还原到固有的网络结构中去认识。所谓动态的观点，就是一切经济监督的联系方式（结构或组织）都不是预成的，而是生成的，不是静止的，而是变动的，也即一切经济监督都有自己运动的过程。因此，认识经济监督的本质要引入时间的因素，要在运动中把握经济监督。所谓反馈的观点，就是一切经济监督的联系不是一种线性因果关系，不是单维单向的，而是多维多向的，是互相制约、互相过渡的，是一种双向的反馈调节，从而使经济监督向着自己的目标发展。所以，认识经济监督的本质要深入揭示经济监督内在的发展机制。总之，用联系、动态、反馈的观点看待一切经济监督现象，这就是有机整体观念的基本特征。

正因为有机整体观念是系统的核心，我们可以提出系统科学方法与经济监督学方法具有相对的同一性，因为人对世界的把握，目的就是要认识世界的本质、宇宙的秘密。在思维中重建世界和谐的秩序，它们都是“自然——人”的巨大系统运动的内在机制。系统科学方法论的诞生正是人类认识史上的一场深刻革命，它是引导人们超越感性分析时代，迈向理性自由王国的有力的思维工具，它与经济监督的方法论有内在的同一性。

1.经济监督对现实生活的把握是把世界基本上看作有机的整体，把社会看成是有生命的东西，因此它具有深刻的系统思维的特征。经济监督是一个复杂的统一体，因此，经济监督正是用系统的方法来处理对象，来把握客观对象。

2.系统科学的整体化原则，事实上是人与对应世界的关系原则。最优化是系统科学方法论的目标，所谓最优化就是根据主体的需要和可能，在系统的动态中协调整体与部分的关系，使部分的功能服从系统整体的最佳目标，以达到整体最优。经济监督过程是一个复杂的自检系统，它通过信息的传输和反馈调节，使之达到目标的契合。(www.daowen.com)

3.系统科学的方法具有解决多因素的动态复杂系统的有效性，这种有效性将使系统科学方法论成为辅助经济监督活动的有力工具和手段。系统科学方法论能在电子计算机的配合下有效地处理多因素、动态、复杂的系统。而经济监督这一系统是一个多参数和多变量的复杂系统，只有用系统科学方法论才能逐步解决它的难点。用系统科学方法论考察经济监督现象，就能使人们对经济监督现象的认识与经济监督本身的状态相适应。

系统科学方法论虽然为不同的学科所适用，但在每一个研究领域，都要根据研究对象的特殊性加以具体化。这是一个艰巨而漫长的历程，它需要几代人的努力。