财政投入方面的主要优点在于：第一，其能够非常直接地反映政府发展战略性新兴产业的意图。政府通过对该产业的核心技术研发进行支持，能够有效地帮助该产业持续快速发展。第二，政策短期效果明显。政府财政对战略性新兴产业补贴，政策落实效果的反馈更直接、迅速，在短期内，对企业的激励效果比较明显。第三，对产业的基础作用起到强化效果。主要从基础设施、政策环境以及公共服务平台等方面提高产业整体的发展能力。第四，补贴的主体应该倾向于战略性新兴产业发展的初创期和成长期，这样有利于帮助企业渡过技术研发的不确定期，抵御失败的风险；财政专项资金的优势在于通过严格的管理和筛选，把资金投给在发展初期表现优秀的企业，从而显著提高财政资金的收益；而事后奖励是对战略性新兴产业发展成果的鼓励，即对企业生产结果的激励，有助于企业进一步扩大规模，提高整体实力。

劣势：第一，容易造成过度的财政补贴。财政投入的对象是关键的技术创新，但是，财政补贴的额度确定往往没有硬性的指标约束，具有较强的主观性，选择资助的企业或项目时很容易受到主观因素的影响，这也是财政投入缺乏效率的重要原因。第二，财政投入的效率不高。由于财政补贴的无偿使用，往往会使资金出现滥用的现象。而且，财政的无偿补贴容易造成企业创新的惰性，甚至可能成为企业盈利的来源。第三，效果不明显。政府财政支持的对象大多集中于成熟性的战略性新兴产业企业，而对中小微企业支持的比例相对较低，而中小微企业恰恰又占据了企业数量的绝大部分，所以财政支持的效果可能不明显。第四，政策执行风险较高。财政资金直接投入企业后，可能会因为企业创新的失败或市场前景不好而导致资金投入的无效益和沉没的风险。第五，不利于市场机制的形成。财政资金补贴或直接投入战略性新兴产业，会不利于战略性新兴产业产品的价格体系的形成，也会造成企业之间的不公平竞争。(www.daowen.com)