1999年6月，自治区党委和人民政府召开了全区第二次乡镇企业工作会议，颁布了《关于加快乡镇企业发展的决定》。该决定明确了“十五”期间加快乡镇企业发展的指导思想、目标和任务，提出发展乡镇企业要坚持“三个有利于”标准，贯彻“合理规划，正确引导，大力扶持，多轮驱动”的原则，实现区内与区外结合，农村与城镇结合，抓大与促小结合，发展与提高结合，立足特色、优势资源，突出特色产业、拳头产品，依托主要城镇，依靠科技进步，以市场供求为导向，以经济效益为中心，以改革开放为动力，促进乡镇企业快速发展”，并制定了加快乡镇企业发展的一系列优惠政策。《关于加快乡镇企业发展的决定》的颁布是西藏乡镇企业发展史上的第三个里程碑，标志着西藏乡镇企业进入快速发展阶段。到2000年年底，全区乡镇企业1 107家，总产值16.8亿元，乡镇企业固定资产总额逾7亿元，产值千万元以上的企业已有16家。[9]

2001年6月，党中央、国务院在北京召开了第四次西藏工作座谈会，会上第一次明确提出西藏应走出一条不同于内地的发展之路，即跨越式发展之路。西藏自治区同时将促进乡镇企业跨越式发展作为实现西藏社会经济跨越式发展的重要组成部分。为了配合西藏跨越式发展战略实施，2002年自治区政府出台了《关于培育和发展农牧业产业化经营龙头企业的意见》，在财税、金融、土地、外经贸、人才等方面给予了诸多优惠政策，并确定了第一批7家自治区级龙头企业，这7家自治区级龙头企业平均固定资产超过1亿元，平均工业产值超过8 000万元，以实现乡镇企业、农牧业产业化经营龙头企业由加快发展转向跨越式发展。到2005年，西藏共有乡镇企业1 260家，从业人员达2.5万多人，总产值达12.5亿元，同比增长19％；实现增加值3亿元，同比增长17％；销售收入10亿元，同比增长16％；上缴税金5 381万元，同比增长43％；实现利润1.3亿元，同比增长18％。[10]

进入“十一五”期间，西藏乡镇企业坚持数量扩张、质量提高和结构优化并重，以促进农牧民就业增收为出发点，以“扶企业、上加工、抓劳务、拓市场、育组织”为重点，实现了乡镇企业、多种经营和农牧业产业化经营龙头企业由加快发展到跨越式发展的新突破。2007年，乡镇企业965家，乡镇企业从业人员达51 961人（固定工28 578人），占全区农村劳动力的4.62％，实现总产值23.5亿元，占西藏农村社会总产值的23.01％，增加值5.17亿元，营业收入19.98亿元，支付职工的工资总额为3.69亿元。其中，自治区级农牧业产业化经营龙头企业产值达10.5亿元，销售收入9亿元，税后利润1.26亿元，初步形成了三级龙头企业协调发展的格局和农牧业产业化经营体系。[11]

图2　1980—2007年西藏乡镇企业总产值变化趋势图

数据来源：《中国乡镇企业统计年鉴（1998—2008）》。

进入21世纪，西藏乡镇企业进入了快速发展轨道，显现出以下新特点：(www.daowen.com)

第一，保持了较高的增长速度。进入21世纪，西藏乡镇企业进入了快速发展轨道，总产值同比增长基本保持在14％以上（除2006年外）。乡镇企业总产值占农村社会总值的比重逐年上升。1994年乡镇企业总产值占农业总产值的7.08％，到2007年，乡镇企业总产值占农村社会总产值的23.01％。

第二，产业结构进一步优化。1978年以前，西藏社队企业从事行业非常少，产业档次低。随着乡镇企业的发展壮大，延伸了农业的生产链，以农畜产品为原料的加工工业和流通业，在工商业中的比重逐步上升，推进农业产业化经营，形成了第一、二、三产业融为一体的综合格局。到2006年，全区乡镇企业955家，农业企业153家，占16％；工业企业193家，占20.2％；建筑企业192家，占20.1％；交通运输仓储企业40家，占4.2％；批发零售企业178家，占18.6％；住宿饮食企业88家，占9.2％；社会服务企业49家，占5.1％；其他企业62家，占6.5％。[12]

第三，所有制结构显现出多元化。西藏乡镇企业发展初期，乡镇集体所有制企业占主体，主要是乡办或村办集体企业。1992年后，特别是进入21世纪以后，个体私营企业发展较快，个体私营企业所占比重大幅度上升。1998年个体企业211家，占总数的21.7％，到2006年，私营乡镇企业达409家，占总数的42.8％。

第四，农牧业产业化经营龙头企业稳定发展。2007年有国家级龙头企业3家，自治区级龙头企业13家，地（市）级龙头企业54家，初步形成了国家、自治区、地（市）三级龙头企业协调发展的格局和农牧业产业化经营体系的雏形。其中自治区级龙头企业产值达10.5亿元，销售收入9亿元，税后利润1.26亿元。[13]。