随着大力发展各地区种植云茯苓产业的热潮，虽云茯苓的产量会有所提高，但其种植产业仍存在诸多问题，如：菌种选育不规范、栽培技术不规范、加工技术不规范、规模化和规范化种植普及不足、产品开发不足、产业链条不完备、松林资源利用率低等。

1.严格菌种管理

茯苓菌种供应存在两个方面的问题：一是不具备资质的单位或个人自行分离、制作、命名、出售菌种。二是有些具备资质的茯苓菌种生产企业，设备简陋，技术人员不足，环境条件差，菌种质量难以保证，导致部分苓农种植的茯苓产量、质量难以得到保证。

针对菌种供应存在的问题，政府要支持和鼓励有资质的菌种生产企业更新制种设备，改造制种设施，改善制种环境，补充和培养技术人员，为广大苓农提供优质的茯苓栽培菌种。加大宣传力度，引导广大苓农从有资质的生产企业购置菌种。

2.提高规范化种植规模

部分苓农缺乏规范化种植及加工意识，为了追求短期经济效益，提前采收，随意使用农药，擅自使用硫黄熏蒸增白，导致产区药材质量不稳定，影响人民群众用药安全。为此，政府要鼓励加快土地流转，提倡规模化种植。制定奖补政策，发挥规模大的种植户和专业合作社的示范引领作用，让更多的苓户进行茯苓规范化种植和初加工，保证茯苓品牌的整体质量。

3.提高初加工机械化水平(www.daowen.com)

目前多数苓户仍沿用手工切、剪及日晒干燥的传统初加工方法，加工设备简陋，费时费力，污染严重。要加速切片机、剥皮机等茯苓初加工机械的研制，鼓励苓农购置加工机械，代替手工作坊式的加工方法，降低人力成本，提高生产效率。

4.延长产业链，提高产业化水平

目前云茯苓产业深加工能力不足，产业链短、附加值低，经常出现增产不增收的情况，极大地挫伤了苓农的生产积极性，影响整个云茯苓产业的稳定健康发展。为此，应加快云茯苓产业园建设，培育、壮大种植地区龙头企业，充分利用优质地区云茯苓原料，开发更多的茯苓医药产品、保健品、食品和日用品，延长、扩展茯苓产业链，增加云茯苓产业的附加值。

5.鼓励山林流转，推广代料栽培技术

传统方法种植云茯苓主要存在两个问题，一是需要消耗大量松林资源，二是开荒挖窑导致水土流失，对山区的生态环境造成较大影响。为解决云茯苓产业发展与生态保护之间的矛盾，一是政府要支持规范化种植企业流转林地，让企业有计划地间伐间种林木，利用砍伐留下大量的树蔸和枝干废料作菌柴。二是寻找云茯苓种植原料的替代品，推广代料栽培技术。

目前的云茯苓生产主要以松树段木或其树蔸作栽培料，选择砂质土壤坡地作栽培场，使用新鲜菌核或人工培育的菌丝菌种作种源，进行人工栽培，生产每年要砍伐大量松树，直接对森林资源和生环境造成影响；而且现有栽培方式还需占用大面积的土地，并容易遭受不正常气候的影响，极大制约云茯苓产业的可持续发展。故在棚室内以代料方式栽培云茯苓取得一定成就，其成活率较高，虽然它的生物效率与传统椴木栽培还有一定的差距，但这种模式值得进一步深入探索，如增加菌袋培养料，或采用3个菌袋，并呈“品”字形排列等方法。