制度虽然是比较优势的重要来源，决定着比较利益的获取与增进。但制度本身所固有的缺陷却限制了这一作用的发挥。

1.制度具有非专利特征

制度属于一种公共品，人们通过简单模仿，无需支付任何费用，就可以复制并使用他人创造的制度，这便产生了制度创新的外部性问题。模仿者的行为则被称为“搭便车”行为。对于模仿者来说，模仿别人的制度创新成果，可以减少自己的设计和创新成本，降低创新风险，对于创新者来说，自己的智力劳动成果被他人无偿使用，就会使创新者的个人收益低于社会整体收益，投入的成本得不到收益和保障。制度的非专利特征产生的“外部性”和“搭便车”现象，导致创新者缺乏激励，不愿进行制度的创造。制度供给处于不足状态，难以满足整个社会的最佳需求量。经济行为缺乏制度约束，影响了制度作用的充分发挥。

2.制度具有资产专用性(www.daowen.com)

与技术的使用没有国界不同，一项新制度的移植与传播会受到来自各方面的制约和限制。在一国效果良好的制度，到另一国不一定行得通。例如，在一些高技术含量的行业中，由于存在强烈的外部性和规模经济特征，政府的制度支持能够有力地降低成本，保护本国市场，促进比较利益增进，这些制度在日本和韩国都已取得了巨大的成功。但在澳大利亚，政府为保护汽车工业实施的各项制度并没有使其发展起来，未能成为有竞争力的出口者。在我国台湾地区，虽然没有政府指导，但制造业甚至某些高技术含量行业的出口也获得了成功。可见，同一种制度支持并不总是能促进比较利益增进的。不同国家的经济发展水平不同，利益格局、价值观念以及意识形态等方面都存在较大差距，受这些因素的限制，制度很难通过简单移植，在不同国家发挥相同或类似的效果。

3.制度受资源的稀缺性制约

制度也是一种“产品”。制度形成、实施和创新的一系列过程，同样需要耗费大量资源。首先，一项新制度的形成往往是集体行动的产物，需要组成有效率的行动团体，并对集体的行动进行组织和协调，确保目标一致，这一过程将消耗大量资源。其次，制度形成后，需要借助一定的强制手段才能保障实施，违反制度的行为将会受到惩罚，遵守制度的行为将会得到激励和保障，这一过程同样将消耗大量资源。最后，制度实施过程中，基于知识的积累和技术的进步，需要打破原有的均衡状态，进行制度的创新，这些活动也将消耗大量资源。总之，制度的形成、发展和完善，不可脱离既定时期、既定资源的约束，受资源的稀缺性影响，制度的供给总是相对不足。制度供求之间的矛盾，限制了制度作用的发挥。