从系统科学的角度分析，“区港联动”属于协同的范畴，是保税区与港口两个子系统整体协同的组织过程。就其内涵而言，可以用“政策叠加、优势互补、资源整合、功能集成”概括，体现了保税区与港区在区域、资产、信息和业务等方面的联动发展。

一、政策叠加

保税物流园区除继续享受保税区在免征关税和进口环节税、海关特殊监管等方面的政策及港区原有的政策外，在税收政策上还叠加了出口加工区的政策，即实现国内货物的进区退税，从而改变了保税区现行的“离境退税”方式，降低了企业的运营成本。在中转集拼方面，中转集装箱在保税物流园区可以进行拆拼箱，改变中转集装箱在港区只能整箱进出的现状。集装箱在保税物流园区堆存无时间限制，改变集装箱在港区有14天报关期限的现状。政策叠加的结果对货物的流动来说，“一线放得更开，二线管得严密”，区内真正实现货物的自由流动。

二、优势互补

将保税区在税收、海关监管等方面的政策优势与港区在航运和装卸等交通便利的区位优势相结合，实现航、港、区一体化运作。集装箱综合处理与货物分拨、分销和配送等业务的联动，既是优势互补，也是优势组合。(www.daowen.com)

三、资源整合

通过保税区和港区在形态、资源上的整合、集成，进货物在境内外快速集拼、快速流动和快速集运，带动信息流、资金流和商品流的集聚和辐射。港、区的资源在保税物流园区项目形成了优化组合。

四、功能集成

实施区港联动的保税物流园区将集成国际中转、国际配送、国际采购和国际转口贸易“四大功能”。