2005年8月11日，甘肃省科学技术厅、甘肃省财政厅、甘肃省机构编制委员会办公室就《甘肃省交通科学研究所体制改革方案》批复甘肃省交通厅“原则同意甘肃省交通科学研究所体制改革方案，组建股份制科技型企业”。

9月27日，省交通厅批复同意“单位名称为‘甘肃省交通科学研究所有限公司’”。10月完成工商注册登记，11月24日，省交通厅党组决定：聘任丁兆民同志为省交通科学研究所有限公司董事长（正县级）。2005年12月，公司正式揭牌成立。它标志着交科所走完了计划经济下、事业型科研机构的行进之路，开始了以市场经济为导向，以公司法人治理结构为核心，建设现代科技型企业的伟大征程。

为了适应建设现代科技型企业的内在需要，新成立的公司开始了前所未有的，以改革劳务用工制度、人事制度、分配制度“三项制度”为主的深刻改革，实行全员劳动合同管理制度，取消干部和工人的身份界限，各级管理人员实行岗位考核招聘制度；专业技术职务实行评聘分开，实行定岗定员、聘任上岗、一岗一薪、岗变薪变的分配制度。(www.daowen.com)

2006年9月29日，科研院召开股东大会，选举产生了公司第一届董事会、监事会，这标志着公司完成了法人治理结构建设紧接着公司党委、纪委、工会先后成立，公司机构设置为三类，一是机关职能部门：总经理办公室、财务资产部、人力资源部（含劳资、离退休人员管理）、党群工作部、总工程师办公室、生产经营部。二是生产部门：甘肃省公路工程质量试验检测中心、研究开发中心。三是所属企业：甘肃省交通职工技术服务站、甘肃新科公路工程监理事务所、甘肃康大公路设计咨询有限公司。