MyBatis和Hibernate都是用于Java持久层的框架，它们的主要区别在于：

1. 对象关系映射（ORM）方式不同：Hibernate是完全的ORM框架，它将对象和数据库表之间的映射关系完全交由框架处理，而MyBatis则采用半自动的ORM方式，开发者需要手动编写SQL语句和结果集映射，可以更加灵活地处理对象和数据库之间的映射关系。

2. 性能和扩展性不同：MyBatis相对于Hibernate来说，更轻量级，因为它没有Hibernate那么多的特性和高级功能。MyBatis具有非常好的性能和可扩展性，可以根据具体应用的需求来进行优化和扩展，而Hibernate则更适合复杂的数据操作场景。

3. 配置方式不同：MyBatis的配置文件较为简单，易于学习和掌握，而Hibernate的配置相对复杂，需要学习更多的概念和知识。

4. 编程风格不同：MyBatis更加倾向于SQL优先的编程风格，开发者需要编写SQL语句来执行数据库操作；而Hibernate则更加倾向于面向对象编程风格，开发者只需要操作Java对象，框架会自动转换成SQL语句执行数据库操作。

总之，MyBatis和Hibernate都是非常优秀的Java持久层框架，选择哪个框架取决于具体的应用场景和需求。如果需要更加灵活的SQL编写和较高的性能和可扩展性，可以选择MyBatis；如果需要更加面向对象的编程风格和全面的ORM功能，可以选择Hibernate。