尊经阁为东阳文庙仅存建筑，处于文庙中轴线的北端，是红椿巷区域旧城改造原地保护的两处古建筑之一。文庙即孔庙。孔庙是历代纪念和祭祀孔子的祠庙，唐玄宗尊谥孔子为文宣王，遂称文宣王庙，元明后省称文庙。东阳文庙初建于唐，宋时始成规模。东阳庙学合一，因此，文庙也即学宫，为封建时代东阳的最高学府。主体建筑为大成殿，皇祐元年（1049）知县鲍安上创建，供奉孔子及其七十二弟子和历代先贤牌位。殿前有泮池，池两侧植古柏，池前为棂星门。殿后为明伦堂，堂后即尊经阁。

尊经阁，顾名思义，是庋藏经籍的楼阁，早年也称藏书阁。清嘉庆八年（1803），知府严荣《尊经阁纪略》说：“东阳向无尊经阁。宋淳熙六年（1179）邑宰王袂始筑藏书阁于明伦堂后，至明崇祯间毁。国初顺治六年（1649）重加修葺，旋亦圮。迄今百数十年间，尽为荒芜丛莽，而经籍则庋于辉映楼，权宜之计也。”南宋王袂所建的藏书阁，时人刘扬庭所撰《藏书阁记》云：“今夫轮奂之美，丹碧之丽，腾榱怒栱，干霄而切云，非以为杰观也。凡记久明远，垂世立教之书，于此乎藏焉。装裭之华，签题之整，巨编奥帙，插架而充栋，非以为文具也。”

大凡重要建筑，屡毁屡建属于常事。明嘉靖十三年（1534），知县吴希孟于明伦堂后复建藏书阁。康熙《新修东阳县志》编者赵衍说：“曾忆往时所见，高可六七丈许，其上有奎星像，下后壁门四扇，方广共一丈五尺，而有魁字，其大如之，为先编修赵祖鹏书，精神奕奕，足称奇观，俗因称为大魁阁。凡科举应试，必至此设祭，谓之祭魁。相传是科有高第，则常发红光，盖亦人精气所聚也。门后卧碑五，即所迁御注五箴。今康熙十三年并毁。”嘉靖十五年，知县王遵与邑人张大需重修明伦堂，易为藏书阁，明末毁。顺治六年（1649）重加修葺，康熙十三年（1674）三藩之乱时即毁于兵燹。其后百年间，“庋书于辉映楼”。辉映楼系邑人胡嘉猷和知县刘伟于南宋绍兴二十六年（1156）始建，位于明伦堂之东。延至清嘉庆六年（1801）辛酉，第三度任东阳知县的徐传一倡重建之议，教谕李如兰、训导钱均协助之。辛酉二月动工，次年十月完工，耗钱二千四百余缗。“高四仞有奇，广七仞有奇，深半广之数。支以石柱，圜以文寮，杗栋榱樀，各称其制，乃易藏书（阁）为尊经（阁）。”（严荣《尊经阁纪略》）此为东阳文庙尊经阁命名之始。其后屡有修葺，最后一次在抗战胜利后。现在的尊经阁，就是嘉庆六年重建之物，距今已212年。阁坐北朝南，后依宫墙，地势爽垲，阁体高畅。五开间，重檐歇山顶。方形阴棱石柱，木梁架，装饰精美，是封建时代东阳境内高规格的建筑之一。

科举时代，尊经阁底楼有时作为考试场所，二楼为藏卷、阅卷场所。太平军占领东阳期间，尊经阁成为储粮之所。1863年春，太平军退出东阳时，尊经阁遗有稻谷万石，在籍内阁学士李品芳会同本邑士绅呈文，说此谷系东阳物产，理当归东阳所有，应增广学额。朝廷允准增加文秀才五名，武秀才三名，永为定制。(www.daowen.com)

晚清尊经阁庋藏之经籍，均为诸生（秀才）必习之书，且大多和科举考试相关。有御批、钦定、圣定、御纂的各种典籍，包括圣训、上谕、《御制诗》、《大清会典》、《大清通礼》、《礼部则例》、《圣谕广训》、《名教罪人诗》、《驳吕留良〈四书讲义〉》、《钦定圣朝殉节诸臣录》、《平定青海、准噶尔、金川碑文》、《训饬州县规条》、《佩文诗韵》以及《乐善堂文集》、《防护录》、《学政全 书》、《乡会墨选》等八十来部一千二百余册，道光《东阳县志》有详目。1922年，县立初中（东中）新建图书馆，尊经阁藏书一并拨充。至此，尊经阁有阁无经，徒存其名。

整修后的尊经阁