从一开始，伊比利亚人在东方的关系就带有不信任的特点。1565年，西班牙人在宿务岛安家落户，3年后，一支葡萄牙舰队试图把他们赶走，结果无功而返。无论如何，葡萄牙人并不能阻止马尼拉与广州之间的直接贸易。就短期来看，大规模地从中国购买丝绸，与新世界白银产量的增长正好同时，从1582年起，白银成了葡萄牙人和西班牙人向明朝缴纳关税的标准。1580年，西班牙的菲利普二世国王登上了葡萄牙的王座，从此之后，葡萄牙就成了西班牙的一部分，直至1640年。两个王国政府合并的消息，直到1582年才随着西班牙政府驻马尼拉公使的到来，而在澳门被人所知。就在大船长、贵族和教士们纷纷宣誓效忠菲利普二世国王的时候，澳门的大船长若奥·德·阿尔布克尔克(他担心澳门失去宝贵的对华贸易的垄断权)却继续执行顽固独立的政治和商业路线，另外，还让葡萄牙的旗帜继续在澳门的上空飘扬。正如帝国的属地在联盟存续期间与西班牙属地保持着分离一样，葡属澳门与西属马尼拉之间也只有很少的接触。占支配地位的，是竞争，而非合作。比方说，1587年，一艘商船直接从阿卡普尔科抵达澳门，此事激怒了马尼拉的西班牙人。两年后，澳门与墨西哥之间的第一次直接贸易也是如此。[26]

然而，自1599年(或者说葡萄牙人定居澳门约45年之后)起，荷兰商船开始出现在这一海域。胡纪伦说，必须把这一活动放到这样一个背景中来看：几十年来，荷兰人和英国人对伊比利亚人在欧洲、美洲和远东的船只和沿海城镇发动了一连串的海上袭击。荷兰人想要夺取澳门、马六甲海峡和长崎，其目的就是要截取利润很高的白银贸易。[27]

这个敌人到达这一地区，也在马尼拉引起了不安，促使王国政府号召东方的天主教势力直面这一威胁。正如新塞哥维亚省的主教在那一年所写的一份关于澳门的西班牙文备忘录中所声称的那样：

(澳门)唯一的支撑，就是在那里从事的与中国人之间的贸易，以及从那里销往日本及其他地方的出口商品。凭借葡萄牙人与中国人之间的友好关系，他们成功地以非常便宜的价格购买原材料，并凭借后来在日本及其他地方所获得的一点点薄利，来养活这些人。我们即使去了那里，也不会有商业上的成功，不会有我们自己中间的和谐，也不会有耐性和冷静，我们要寻求更大的利润。(www.daowen.com)

此外，主教继续说道：澳门的葡萄牙人独自养活了日本的基督徒，“如果澳门丢了，日本也就给毁了”。[28]

当澳日贸易威胁着马尼拉的繁荣的时候，西班牙人对澳门的兴趣也是所有权。1619年，一个名叫福莱·迪亚哥·阿度阿尔特的人建议西班牙摧毁澳门。他指出，与日本之间的大多数白银贸易都是澳门的葡萄牙人在经营，而且，如果通过赶走葡萄牙人来截取这一贸易的话，那么就会有助于马尼拉。他坚持认为，迫使葡萄牙人撤回印度群岛，只会有利于葡萄牙王国政府，因为澳门并不向他们的国王而是向中国皇帝缴纳贡赋。而且无论如何，是马六甲海峡为了葡萄牙民族的荣誉而养活了澳门。他指出——非常正确——这就是葡萄牙人对中国人的依赖，没有中国官员的许可，他们甚至连一堵屋墙都造不了。另一方面，他指出，除了每年有两艘船从澳门贩运丝绸到果阿之外，澳门其实很穷。由此，他得出结论，总的说来，作为两个伊比利亚王国，西班牙的利益和葡萄牙的利益有一个共同的敌人，这就是荷兰。此外，马尼拉对澳门比对果阿更重要。他断定，更好的做法是，让所有的利润(全都是白银)流向西班牙，至少要像白银曾流回到葡萄牙那样。有人认为，澳门充当了基督教在中国的滩头堡，这个论点有一定的价值，但被下面这个事实所削弱：葡萄牙人提供了这样一个负面的实例，以致他们实际上妨碍了基督教信仰的传播[29]。结果，在1620至1644年间，有54艘商船抵达马尼拉被记录在案。当时，西班牙和葡萄牙的王国政府再一次分道扬镳，贸易也走向了终结。[30]

中国商船